巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病理改变，就是原本应存在于子宫内的子宫内膜跑到卵巢部位生长。当每个月月经来潮时，体内激素刺激卵巢内的子宫内膜组织，产生经血积聚在卵巢内而形成一个囊肿，因为囊肿内黏稠液体及颜色类似巧克力，故称为巧克力囊肿。
研究表明，卵巢异位囊肿是否合并深部浸润型子宫内异症以及卵巢储备能力是影响试管婴儿助孕后妊娠率的独立因素。与单纯性输卵管因素不孕的患者相比，卵巢异位囊肿的存在并不影响试管婴儿助孕结局；助孕前接受腹腔镜下囊肿剥除术也不会改善试管婴儿助孕结局，但是手术会降低卵巢对超促排卵的反应。
对于巧克力囊肿或者内膜异位、宫腔粘连的患者，强调腹腔镜是首选的手术治疗方式。手术探查的目的是祛除病灶，对生育系统进行评估，恢复良好的状态，为妊娠创造良好的条件。但对高龄不孕患者，卵巢储备功能是必须首先纳入考量的因素。
对于有高危因素的患者，如年龄在35岁以上、不孕年限超过3年，尤其是原发性不孕者，重度内异症、盆腔粘连、病灶切除不彻底者，输卵管不通者，复发型内异症或卵巢储备功能下降的，应积极行辅助生殖技术（试管婴儿）助孕。
巧克力囊肿切除后多久才可以怀孕？
一般在手术过程中，可以评估子宫内膜异位症严重的程度。如果是轻度内膜异位症，鼓励患者在半年黄金时间内积极试管助孕。如果是中重度程度，则需要在术后追加药物治疗3至6个月，以防复发。
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