女性的子宫内膜是胚胎植入的地方。试管婴儿为什么植入的胚胎不能着床成功，一部分是由于子宫环境不良造成的。经过生殖科学家的研究，子宫环境导致的胚胎着床失败的原因可归纳于下列几种：
1.子宫构造异常
子宫构造异常，如：子宫先天发育畸形（双角子宫、子宫腔有纵膈）、子宫内膜息肉、子宫内膜炎和子宫腔内肌瘤。
2.子宫内膜薄或过厚
生殖临床中往往用阴道超声来监测内膜的厚度甚至是内膜的血流信号作为评估内膜简单且可靠的方法。通常根据排卵日之前或者移植日当日子宫内膜厚度作为评估指标，范围应该在8至14mm。一般认为内膜大于等于8mm时胚胎种植成功率会明显提高。
内膜厚度过薄，就像盐碱地，贫瘠不堪；内膜厚度过厚，就像是沼泽地，泥泞不堪，这两种情况对于胚胎的着床都是相对不利的。
3.子宫腔持续积水
输卵管水肿及不通会造成子宫腔积水，这是因为输卵管的积水因输卵管伞部（尾端）阻塞，造成输卵管内的积水往子宫腔流之故。
持续性的子宫腔积水会造成胚胎着床失败。但多囊性卵巢症患者她们在接受排卵药物刺激之后，偶尔也会引起子宫腔积水，但不会造成着床不易（失败）的问题。
4.子宫内膜细胞分泌的黏着蛋白
女性的子宫内膜细胞在分泌一种黏着蛋白，帮助胚胎着床，而如果粘着蛋白如果品质较差，量不足或者是子宫腔中某些细胞数的含量太多，太少等都会影响胚胎的着床，如果收到这些因素的干扰，也会导致胚胎无法着床，进而出现胚胎移植失败的现象。其中最常见的是黄体功能不全，黄体功能不全可造成子宫内膜发育迟缓和黄体期短，从而影响受精卵的种植，或早期妊娠流产。
5.有自体免疫疾病或有血栓形成体质
有自体免疫疾病或有血栓形成体质和习惯性流产有关是不争的事实，但和胚胎重复着床失败是否有关联，目前还没有定论。
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