胎停育的成因复杂，多数和胚胎自身异常有关系。还有其他一些原因，如黄体功能不足，高泌乳素血症，甲状腺功能异常以及糖尿病等。
1、免疫因素 由于人体的免疫机制，如果母体与胎儿之间免疫不适应，就有可能引起母体对胎儿的排斥，导致胎儿停育。 免疫因素导致的胚胎停育相对少见，而且无法明确诊断。 2、内分泌因素 胚胎着床及继续发育依赖于复杂的内分泌系统彼此协调，任何一个环节失常，都可致流产。 其中，3种激素对胚胎早期发育影响尤为重要：雌激素，孕激素，人绒毛膜促性腺激素。如果母体自身内源性激素不足，就满足不了胚胎的发育需要，造成胎停和流产。 造成胎停最常见的内分泌因素是黄体功能不良。黄体功能不全可造成子宫内膜发育迟缓和黄体期短，从而影响受精卵的种植，或早期妊娠流产。
3、子宫异常 子宫是胎儿的育床，子宫里的内环境、子宫整体的环境都对胚胎发育有所影响。内环境是指子宫内膜，如果太薄、太厚都会影响着床。由于子宫缺陷引起的流产约占10%~15%！ 常见的异常子宫有：先天性苗勒氏管发育异常、宫腔粘连、子宫肌瘤及子宫内膜异位症、先天性或损伤性宫颈口松弛。 4、其他 胎停育成因复杂，还有其他一些成因，如精子质量、环境因素等。特别的，孕妇在孕期，感染、接触放射性物质、有毒的化学物质，或是服用孕期禁止服用的药物等都有可能造成胎停育。
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